關于用微波爐熱牛奶是否會破壞牛奶的營養成分問題，關鍵在于加熱時間的長短。因為微波爐的加熱速度極快，而保存牛奶營養成分的溫度不能太高。
據有關資料顯示，微波爐的殺菌能力主要來自于熱力效應和生物效應。熱力效應能使細菌的細胞蛋白質受熱變性凝固，導致細菌死亡。如果用微波爐加熱牛奶時間過長，會使牛奶中的蛋白質受高溫作用，由溶膠狀態變成凝膠狀態，導致沉積物出現，影響乳品質量。牛奶加熱的時間越長、溫度越高，其中營養的流失就越嚴重，主要有維生素，其中維生素C流失得最厲害，其次是乳糖。
飲用一杯約250毫升的牛奶，用煤氣灶加熱的話，通常是70℃的高溫煮3分鐘，60℃煮6分鐘即可。那么用微波爐，1分鐘左右就行了。但要注意使用微波爐加熱會有溫度不平均的現象，所以喝之前攪拌一下才不會被燙著。
專業人士還明確表示：直接把袋裝奶放進微波爐加熱，對人體健康會產生不利影響。如果包裝材料上沒有注明“可用微波爐加熱”的字樣，就不適宜直接放入微波爐中加熱。必須先將牛奶倒入微波爐專用的容器內，再用微波爐加熱。在100℃以下，一般的塑料不會產生問題，建議用100℃以下的開水燙溫奶袋，使牛奶溫熱。
不過，專家指出，如果能避免加熱飲用就盡量不要加熱，這樣能保存牛奶完好的營養價值。特別對于孩子而言，完好的牛奶營養更有利于成長和發育。像商場或超市中銷售的純牛奶，一般衛生保障都比較可靠，在飲用不需要加熱。
