近年來許多研究報告探討益生菌的療效、功能及治療的安全性。許多益生菌已成為廣為使用的健康食品,而最常用的是乳酸菌,許多研究報告證實對兒童的過敏及腹瀉有所療效。在臺灣,市場上有許多益生菌產品販賣,包括養樂多、優酪乳等,許多家長們常購買做為兒童的零食。這些益生菌的害處很少被報告,醫學文獻上僅有極少數成人病患,被報告因使用益生菌造成嚴重的感染疾病。
2005年1月份兒科醫學雜志(J. Pediatrics 2005,115:178-181),美國北卡羅來納的蘭德醫師等報告2位兒童病例,年齡分別為6周及6歲,均因嚴重細菌感染而使用大量的抗生素治療,但造成嚴重腹瀉的合并癥,故使用益生菌(乳酸菌)治療腹瀉。但在使用乳酸菌20~40天后,再度發燒,引起敗血癥,而且血液培養出乳酸菌后,經抗生素治療后痊愈。
雖然乳酸菌為益生菌,對健康的成人及兒童均有所助益,對兒童腹瀉也有所幫忙,但在體弱多病或免疫缺乏的幼兒,也可能引致敗血癥、心內膜炎,所以必須小心使用,甚至需暫時禁用。