當精液異常的時候，應該考慮有沒有一些相關的疾病，這對于確立診斷是非常重要的，上海某醫院劉主任說，這也是提高治療效果的唯一途徑。
常見的導致精液異常的疾病因素有以下幾點：
1. 性傳播性疾病引起精液異常;
在整個人群中，患有性傳播性疾病與未患此病者的無精子癥發生率相似，但是前者精液分析異常發生率顯著較高。性傳播性疾病似乎不影響精子密度，說明不會引起輸精管道狹窄或堵塞。性傳播性疾病者一般表現在精子活動率下降，這與附性腺功能的紊亂特別是與附睪炎有關。不可忽視的是，解脲支原體、沙眼衣原體感染在臨床上也是很常見的，而且這些感染并沒有顯著的癥狀，更有一定的隱蔽性。
2. 腮腺炎;
青春期前后發生腮腺炎，并不會引起無精子癥的發生率增加，但是伴有較高的異常精液的可能性。青春期后發病者精子密度明顯低于未發病者或青春期前發病者。腮腺炎病人中僅有 4.4% 合并有睪丸炎。青春期前患病者很少合并睪丸炎，但是青春期后患病則可以發生。睪丸炎顯著影響精子質量，增加無精子癥的發病率，特別是雙側睪丸炎。無論是單側或雙側睪丸炎，精液分析異常者增加。總之，腮腺炎特別是合并睪丸炎時，對生育會產生不良的影響。
3. 睪丸本身的問題;
睪丸下降不良也是很常見的因素，具有這種病史的人無精子癥發生率顯著升高，并且雙側睪丸下降不良者的無精子癥發生率比單側的高兩倍。這類患者即使有精子，精液質量也異常，尤其是少精癥顯著升高。睪丸損傷往往影響其正常功能，雖然許多男性在生活中發生過一定程度的睪丸損傷，但是這里僅記錄了那些伴有陰囊血腫或血尿，說明有睪丸或生殖尿道損傷的不育患者的情況。這類病人的無精子癥或精液異發生率顯著增加。
睪丸損傷常伴有尿道癥狀( 16.8 %)，而無損傷者則僅有 8.8% 出現這種癥狀，兩者有顯著差異。而且前者的附性腺感染率也較高。睪丸扭轉盡管發病率不高，一旦發病常常并發無精子癥和少精癥。附睪或睪丸炎也是常見的疾病，這類病人的精子密度和活動率顯著低于無這種病史的人，睪丸體積較小。尿道癥狀可能有免疫因素，附性腺炎癥的發生率也較高。
4. 泌尿系統疾病;
如果排尿困難、尿頻、血尿等癥狀，應該排除精囊炎、前列腺炎等可能。這些病人有較高的無精子癥的傾向，更常見精液質量異常，特別是精子形態和活動率較低。有泌尿系統癥狀的患者中， 27 %前列腺液化驗異常，或者精液細菌學、細菌學或生化學檢查異常，應該進一步檢查確診。
5. 其他疾病;
支氣管炎也可能導致精液異常，支氣管炎常常是延及全身的纖毛功能紊亂的臨床表現。這類病人中，無精子癥發生率顯著增高。所有這種病人的睪丸容積正常，說明無精子癥是由于輸精管道堵塞引起的。支氣管炎患者的精液分析異常率增高，精子平均密度和向前運動的精子比例較低。
糖尿病也是常見的，糖尿病與射精功能障礙相關，并不引起無精子癥或者精子質量異常，所以，糖尿病對生育的影響是通過性功能紊亂而造成的。具有神經系統病史的患者常常表現為射精障礙，但無精子癥和精液質量異常的發生率并無增加。
