由于某些醫生只注意性病所表現的生殖器部位的皮膚損害，而忽視了其他疾病同樣可導致相同的癥狀，結果盲目輕率地將本來不是性病的誤診為性病，給患者造成不必要的痛苦和精神壓力。
其實，生殖器部位發生的許多皮膚損害，很大一部分并不屬于性病，兩者決不可混淆，現將這些容易與性病相混淆的疾病介紹如下，以期引起注意。
過敏性疾病
服用藥物后過敏，可引起龜頭包皮發生固定性藥疹；藥物或食物過敏還可引起包皮嚴重水腫；接觸外用藥，避孕工具或尿布等引發的接觸性皮炎，如局部發生紅斑、丘疹、水皰、糜爛或潰瘍；個別婦女對精液過敏可發生陰道奇癢或外陰部蕁麻疹。
外傷性疾病
性交過程中發生擦傷和血腫；性交后因淋巴管暫時阻塞可引起陰莖背或冠狀溝出現軟骨樣硬索，幾周內可自行消失，此癥為陰莖硬化性淋巴管炎；長時間的性交可引起生殖器水腫；包皮翻轉后不能復位，可引起包皮及陰莖末端嚴重水腫，稱為嵌頓包莖；昆蟲的叮咬也可引起生殖器部位的紅腫和水皰。
非性病性感染
生殖器下段的腐物寄生粗大桿菌時，可引起急性女陰潰瘍；性交2-3天后，由于包皮垢桿菌或奮森壓螺旋體或梭形桿菌感染，也可引起糜爛性包皮龜頭炎。
癌前期疾病和惡性腫瘤
生殖器部位發生的白斑、肥厚紅斑，尤其是表現角化粗糙、脫屑、疣狀增殖和頑固性潰瘍者，可能是癌前期疾病或惡性腫瘤。
良性腫瘤或贅生物
生殖器部位還常見到一些發展緩慢、持久存在的且疹或小結節，顏色有黑、黃、紅或皮膚色。其病灶可能是珍珠狀陰莖丘疹病、粟丘疹、黑色素痣、表皮痣、淺表脂肪瘤樣痣、皮膚子宮內膜異位、前庭大腺囊腫、皮脂腺囊腫、多發性脂囊、脂肪瘤、生乳頭汗腺瘤、血管瘤、平滑肌瘤、纖維瘤或皮膚淋巴細胞瘤。
其他疾病
還有一些原因復雜或至今病因不明的疾病，同樣也能導致生殖器部位或全身性病損，如陰莖海綿體硬結癥、漿細胞龜頭炎、閉塞性干燥性龜頭炎、云母狀和角化性假上皮瘤性龜頭炎、女陰萎縮、陰莖干枯、硬化性萎縮性苔蘚、扁平苔蘚、濕疹、脂溢性皮炎、神經性皮炎、銀屑病、天皰瘡等。此外，性傳播損害容易與一般皮膚病相混淆，也要注意區別。
