患兒必須隔離，食具的消毒可在開水中煮沸１５分鐘，玩具可給予易于消毒的木制或塑料制品。大便的處理，可以大便１份，漂白粉１／４份，放在痰盂里攪勻后加蓋２小時再倒掉，床單被褥可在日光下曝曬６小時。
患兒應臥床休息。腹痛時腹部可放熱水袋。嬰幼兒大便有里急后重時，可讓大便解在尿布上，不要求坐起在痰盂里解便，這樣可防止肛門直腸脫垂。每次大便后用溫水洗凈臀部，并用５％鞣酸軟膏涂于肛門周圍的皮膚上。如有脫肛時，可用紗布或軟的手紙涂上凡士林，托住脫垂的肛門，一面輕輕按摩，一面往上推，即可復位。
嘔吐頻繁時，可短期禁食，或給予靜脈補液。然后給予糖鹽水、少油膩的流質，如藕粉、豆漿等。待病情好轉，即應及早進食。這時可以給予少渣、易消化的半流質，如麥片粥、蒸蛋、煮面條等，牛奶易引起腹瀉脹氣，應予限制，待大便成形后可適當增加。應多補充水分。在恢復后期，應設法引起患兒的食欲，也可以食前半小時先服消化酶類藥物如胃蛋白酶等，并在飲食中增加營養和蛋白質，開始可少食多餐，逐漸增加，防消化不良。
慢性菌痢患兒需要灌腸時，應對患兒做好解釋工作，爭取患兒配合，不致使藥液流出肛門，同時在灌腸前先將大小便排空。
大便作細菌培養采取標本時，應選膿血及粘液較多的地方，留好標本后應立即送驗，以提高準確性。若連續３次送驗均為陰性，可解除隔離。密切注意患兒病情變化及大便性質、次數，如患兒出現高熱、面色蒼白、四肢發冷或有嗜睡、譫語、煩躁不安時，應立即到醫院就醫。
